Да, все хранится в базе. Предназначение конфига - обеспечить доступ сервера к базе.
Если базы одинаковые, то можно воспользоваться средствами самой базы (mysqldump, etc.).
Если базы разные, то да, это лучше делать собственной утилитой.
Если базы одинаковые, то можно воспользоваться средствами самой базы (mysqldump, etc.).
Если базы разные, то да, это лучше делать собственной утилитой.

